Ян Черский родился 3 мая 1845 года в имении Сволна Витебской губернии. Учился в Виленском университете. Учавствовал в восстании 1863—1864 года за что был лишен шляхетского звания, сдан в солдаты и сослан в Сибирь. В 1869 году был освобожден от службы в армии. Находясь в ссылке, Ян Черский проводил геологические и палеонтологические исследования окрестностей Омска. В 1871 году переехал в Иркутск, где прожил 15 лет, работая в Восточносибирском отделении Императорского Русского географического общества.
На новом посту Ян Черский изучил строение берегов Байкала, составил первую геологическую карту его побережья, исследовал бассейн реки Селенга и Нижней Тунгуски. За заслуги в исследовании Сибири он награжден золотыми медалями Русского географического товарищества. В 1891 году Черский возглавил экспедицию в районе рек Колыма и Индигирка. Умер Ян Доминикович в 47 лет во время обследования низовья Колымы. Его именем назван хребет — горная система, которая тянется на 1500 километров от нижнего течения реки Яна до верховьев Колымы. Наибольшую высоту - в этой горной системе имеет гора Победа 3147 метров. Кроме того, его именем названы гора Черского - горная вершина на Байкальском хребте, берег Черского - берег Байкала в Варгузинском заповеднике и поселок в Якутии.